Når både virksomheden og institutionen bidrager til at finansiere et ph.d.-forløb taler man om samfinansieret forskeruddannelse.
Ved aftaler om samfinansieret forskeruddannelse er det universitetet, der som arbejdsgiver for den ph.d.-studerende, indgår aftale med den private partner om rettighederne til den ph.d.-studerendes opfindelser.
Samarbejdsaftaler, hvor der indgår forskerstuderende, skal særligt tage hensyn til, at de studerende skal offentliggøre og forsvare deres ph.d.-afhandling.