Når både virksomheden og institutionen bidrager med ressourcer, taler man om samfinansieret forskning.
Ved aftaler om samfinansieret forskning er det krav, at resultaterne skal offentliggøres, og at virksomheden ud over projektfinansieringen skal betale særskilt for de immaterielle rettigheder, som institutionen overdrager. Universiteter kan alene engagere sig i samfinansieret forskning, hvor projektet er af videnskabelig interesse.