SAFIR: Structural Analysis of Amyloid Fibrils in Realistic Environments

Protein fibrillering sker, når det ellers funktionelle og korrekt foldede protein ændrer sin tredimensionelle struktur og former små celle/neuro-toksiske oligomerer efterfulgt af meget store uopløselige protein-aggregater kaldet fibriller. Protein fibrillering spiller en central rolle i adskillige fatale sygdomme, som f.eks. Alzheimers og Parkinsons sygdom, type II diabetes og Creutzfeldt-Jacob, med store negative konsekvenser for vores samfund. Disse sygdomme er aldersrelaterede og udgør et voksende problem i den aldrende befolkning. Proteinbaserede lægemidler er også kendte for at kunne fibrillere under produktion og opbevaring, hvorfor fibrillering er et fokusområde i den farmaceutiske industri, hvor proteiner og protein-fragmenter i dag udgør et ud af fire nye godkendte lægemidler på markedet. Til trods for næsten et århundredes intens forskning inden for området forstår vi i dag stadig kun de mest overfladiske detaljer om de molekylære mekanismer bag dannelsen af fibriller. Projektgruppen er pionerende inden for anvendelsen af små-vinkel røntgen spredning (i daglig tale benyttes den engelske forkortelse SAXS) i opløsning, mens fibrilleringen forløber. Vi benytter altså avancerede biofysiske metoder, som giver en helt ny type information fra disse komplekse molekylære processer. Projektet har til formål at give en tredimensionel strukturel forståelse af de molekylære processer, der forløber, når proteiner fibrillerer. Herigennem søger projektet at belyse, hvad der har den toksiske effekt for celler, og hvad man kan gøre for at forhindre fibrillering. Altså hvordan kan vi udvikle inhibitorer til anvendelse både i den (bio)farmaceutiske industri og som lægemiddel ved de alvorlige sygdomme.