Sydafrika er en af de største økonomier i Afrika. De sydafrikanske universiteter rangerer i uddannelses- og forskningskvalitet uden sammenligning højest i Afrika. Sydafrika har 4-5 universiteter blandt verdens top-500, en række spirende uddannelses- og forskningsmiljøer af høj kvalitet og er en vigtig indgang til det afrikanske kontinent.
Siden apartheids ophævelse i 1994 har langt de fleste sydafrikanere fået adgang til vand, men vandmangel hæmmer stadig den økonomiske udvikling. Sektorsamarbejdet med Sydafrika omkring vand omhandler grundvand, vandspild og vandeffektivitet i industri. Forskning og innovation er en integreret del af alle tre spor.
UFM underskrev i 2017 et Memorandum of Understanding med det sydafrikanske forskningsministerium Department of Science and Innovation om samarbejde om forskning og teknologi. Aftalen er i øjeblikket i proces for forlængelse.
Danske forskere og innovationsaktører arbejder tæt sammen med sydafrikanske forskere i en række vand- og miljøprojekter. På den danske ambassade i Pretoria i Sydafrika er den udsendte sektorrådgiver på vandområdet et centralt omdrejningspunkt for myndighedssamarbejdet og for kontakten til lokale uddannelses- og forskningsinstitutioner og innovationsaktører.
Sydafrika deltager også i forskellige internationale programmer og organisationer, som kan danne ramme om samarbejde med danske partnere. Det gælder både Horizon Europe, som er EU's rammeprogram for og EUREKA, som er en netværksorganisation, hvor nationale forsknings- og innovationsprogrammer kan koordineres i fælles projekter.